Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vps8Q0P5W1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms