Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms