Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TrioQ0KL02 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms