Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms