Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms