Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms