Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SctQ08535 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SctQ08535 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SctQ08535 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SctQ08535 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SctQ08535 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SctQ08535 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SctQ08535 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SctQ08535 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms