Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms