Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms