Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprgQ05909 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprgQ05909 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms