Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nf1Q04690 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms