Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnd1Q03719 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms