Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnb1Q03717 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnb1Q03717 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms