Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms