Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Muc1Q02496 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms