Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms