Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms