Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms