Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms