Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmgcrQ01237 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HmgcrQ01237 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms