Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms