Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms