Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gabpb1Q00420 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabpb1Q00420 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gabpb1Q00420 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gabpb1Q00420 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gabpb1Q00420 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gabpb1Q00420 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabpb1Q00420 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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