Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms