Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SgcdP82347 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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