Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabpb2P81069 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms