Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms