Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msx3P70354 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Msx3P70354 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msx3P70354 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msx3P70354 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msx3P70354 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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