Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frat1P70339 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frat1P70339 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms