Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms