Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ElobP62869 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ElobP62869 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ElobP62869 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ElobP62869 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ElobP62869 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms