Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms