Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms