Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap25P60879 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms