Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P58686 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P58686 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P58686 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms