Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Paxbp1P58501 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms