Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctdsp1P58466 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms