Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms