Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nub1P54729 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nub1P54729 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nub1P54729 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nub1P54729 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nub1P54729 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nub1P54729 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nub1P54729 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nub1P54729 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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