Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms