Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CnbpP53996 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CnbpP53996 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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