Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec1P51908 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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