Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CntfP51642 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CntfP51642 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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