Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TspoP50637 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TspoP50637 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TspoP50637 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TspoP50637 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms