Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms