Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnni3P48787 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms