Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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