Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VdrP48281 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VdrP48281 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VdrP48281 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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