Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl13P47963 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms