Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms